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      貴黔醫院精準醫學中心通過宏基因組高通量測序質評

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      2023年11月,貴黔國際總醫院(以下簡稱“貴黔醫院”)精準醫學中心成為貴州首家高分通過國家衛生健康委臨床檢驗中心cfDNA 宏基因組高通量測序室間質評的實驗室。據悉,貴黔醫院精準醫學中心是貴州省首個開展病原微生物宏基因組本地化檢測的實驗室,本次全國血液微生物 cfDNA 宏基因組高通量測序室間質評的通過亦是貴州省唯一的檢測機構,是高通量測序本地化檢測的又一里程碑!


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      室間質評證書


      血漿游離 DNA(cfDNA)宏基因組高通量測序(mNGS)可為多種類型血流感染病例的臨床診斷提供重要的病原學依據。由于血漿中微生物 cfDNA 含量極低且高度片段化,易受實驗室環境中微生物及其核酸污染導致假陽性結果,且 mNGS檢測流程非常復雜,因此對實驗操作及實驗室管理的要求很高。


      本次預研活動旨在了解國內mNGS實驗室檢測血漿微生物cfDNA 的現狀,通過考察各實驗室14個樣本中39個cfDNA濃度達1.5×103copies/mL 及以上的細菌、真菌和DNA病毒的檢出情況,對實驗室檢測結果的準確性、近緣菌株鑒定、報告解讀等多個方面能力進行考核,對mNGS檢測方法和實驗室人員綜合能力提出更高要求。


      數據顯示,接受報名的實驗室共146家,實際收到130家有效回報結果。按照≥90分為合格的標準,合格率為78.46%(102/130),滿分通過率僅為38%(50/130)。


      值得一提的是,在合格的102家實驗室中,僅有貴黔醫院精準醫學中心來自于貴州。


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      實驗室屬地分布


      貴黔醫院精準醫學中心病原微生物宏基因組平臺采用先進設備——華大MGISEQ-200測序儀,專利文庫構建方法檢測,可接收貴州省及鄰近省份各大醫療機構的樣本,滿足臨床醫生對DNA、RNA類病原體檢測需求,同時提供完善的報告咨詢解讀服務。


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      貴黔醫院精準醫學中心MGISEQ-200測序儀


      據了解,此前貴州省病原微生物宏基因組樣本需送省外進行檢測,出具報告最快也要24至48小時。而現在,有了貴黔醫院精準醫學中心搭建的檢測平臺,可控制在24小時內出具宏基因組檢測報告。這對感染性疾病,尤其是重癥患者、急性或疑難感染者病原體的快速診斷具有重大意義。


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      貴黔院精準醫學中心實驗員進行mNGS建庫操作


      依托高質量的檢測服務和嚴格的實驗室質量管理體系,在此次室間質評活動中,貴黔醫院精準醫學中心不僅實現了應檢出病原全部報告,樣本預期結果中其他低豐度的微生物也全部正確報告,圓滿通過本次考驗。


      此次室間質評的優異成績,再次驗證了貴黔醫院精準醫學中心mNGS方法從DNA提取、建庫測序,到數據質控、物種分類、微生物數據庫組成到閾值設定等各環節的科學性及報告解讀的準確性,實驗室有能力為臨床提供精準、快速、可靠的病原學依據,助力臨床精準診療! 


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      貴黔醫院精準醫學中心病原微生物宏基因組檢測指引


      來源 貴黔國際總醫院

      編輯 汪盈平

      二審 楊國軍

      三審 黃銳

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